Organizacja

Urząd Kontroli Skarbowej w Warszawie jest jednostką organizacyjną kontroli skarbowej podległą ministrowi właściwemu do spraw finansów publicznych. 
W ramach Urzędu Kontroli Skarbowej w Warszawie działają zamiejscowe komórki organizacyjne Urzędu:
w Ciechanowie, Płocku, Radomiu i w Siedlcach.
Terytorialny zasięg działania Urzędu obejmuje województwo mazowieckie. Siedziba Urzędu znajduje się w Warszawie przy ul. Cybernetyki 19B.

Urzędem kontroli skarbowej kieruje dyrektor, który jednocześnie jest organem kontroli skarbowej.
Dyrektor urzędu kontroli skarbowej jest odpowiedzialny przed Generalnym Inspektorem Kontroli Skarbowej za prawidłową i terminową realizację zadań urzędu.
Dyrektor urzędu kontroli skarbowej w szczególności:

• organizuje pracę urzędu kontroli skarbowej i jest przełożonym zatrudnionych w nim inspektorów oraz innych pracowników,
• ustala plany kontroli,
• upoważnia inspektorów i pracowników do przeprowadzenia czynności kontrolnych,
• wydaje decyzje w sprawach określonych w ustawie,
• wydaje wyniki kontroli,
• dokonuje, w szczególnie uzasadnionych przypadkach, zmiany inspektora lub pracownika prowadzącego czynności kontrolne,
• może podawać do wiadomości publicznej zbiorcze informacje dotyczące działalności kontroli skarbowej na terenie objętym zasięgiem działania urzędu kontroli skarbowej.

Dyrektor urzędu kontroli skarbowej kieruje pracą urzędu przy pomocy wicedyrektorów, głównego księgowego, naczelników wydziałów, kierowników i innych pracowników zatrudnionych na stanowiskach samodzielnych.
Wydziałami kierują naczelnicy, a pozostałymi komórkami organizacyjnymi - kierownicy lub koordynatorzy.
Dyrektor urzędu kontroli skarbowej sprawuje nadzór nad pracą pracowników urzędu.
Pracownicy komórek wywiadu skarbowego, w zakresie wykonywanych czynności operacyjno-rozpoznawczych, podlegają nadzorowi Generalnego Inspektora Kontroli Skarbowej.
Dyrektora urzędu kontroli skarbowej powołuje, spośród kandydatów wyłonionych w drodze konkursu, i odwołuje minister właściwy do spraw finansów publicznych, na wniosek Generalnego Inspektora Kontroli Skarbowej.
Wicedyrektorów urzędu kontroli skarbowej powołuje, spośród inspektorów kontroli skarbowej, i odwołuje Generalny Inspektor Kontroli Skarbowej, na wniosek dyrektora urzędu.